内科现有主任医师1名，主治医师1名，住院医师1名，主要承担内科各系统疾病的诊断与治疗，特别是在妊娠剧吐合并代谢紊乱、妊娠合并呼吸及消化系统疾患、心血管系统疾患、内分泌系统疾患及泌尿系统疾病的防治有专科特色，并开展孕产妇合并内科疾患的孕期全程监测，以确保母婴安全。另外还承担了妇科围手术期内科相关疾病的诊疗，配合产科成功进行了羊水栓塞、急性心功能不全、失血性休克、DIC、糖尿病酮症酸中毒等危重症的抢救。
厦门市妇幼保健院乳腺专科是以乳腺癌预防和筛查，乳腺癌早诊早治，以及以外科治疗为中性的多学科协作的综合治疗专科。科室成立以来，在各级院领导的支持下，医院专科获得了快速发展，开展了一批国内前列的乳腺良恶性疾病的诊治项目。目前有40张病床，专科拥有全省较早的三维钼靶立体定位穿刺活检系统，以钙化为主要表现的乳腺病灶可以微创切除，准确定位活检。2005年我院在全省首先开展超声引导下乳腺微创手术（麦默通手术），在超声引导下准确切除病灶行病理活检，从而保证了诊断的准确性，创伤的较小化，目前科室用两套麦默通真空辅助的乳腺微创旋切系统，年完成各类微创手术近1000台，8年来一直位居全省一位。
该科技术力量雄厚、设备先进，以乳房肿瘤、乳房良性疾病、乳房保健、乳房美容整形为重点，承担全市妇女的乳房保健、医疗、科研及乳腺医学知识的普及工作，是卫生部“全国百万妇女乳腺普查工程”闽南地区惟一定点普查单位。卫生部项目福建“万名妇女乳腺癌普查”指定单位。 乳腺专科现有15张病床，2张监护床。病房设计以人性化，充分体现了温馨、呵护、关爱的特色。各间面积30平方米，环境优雅，设有独立卫生间，24小时热水供应，电视观赏。可满足不同经济层次的需求，分为单间、双人间、三人间。前者为家庭式住院方式，配备电话、冰柜。 乳腺专科有主任医师3人，副主任医师1人，乳腺专业博士研究生1名，整形硕士研究生1名，主治医师1名，住院医师2名。
厦门妇幼保健院产科是集医疗、保健、教学、科研为一体的科室，在闽西南地区享有声誉，在医院具有举足轻重的地位。学科建设完善，现有母体医学、胎儿医学、普通产科。 现开放床位190张（包括MICU），现有科室人员159名，其中高级职称13人，中级职称30人，硕士8人，博士1人。年门诊量达92000人，年分娩量达13000人，居全省前列。
医生姓名：钟红秀
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：产科
医生姓名：张雪芹
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：产科
医生姓名：吴琦嫦
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：产科
医生姓名：黄慧珍
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：产科
厦门市妇幼保健院妇科拥有一支训练有素、技术精良、无私奉献的技术骨干团队，在闽西南享有很高的声誉。有床位120张，医护51人，其中有高级职称8人。年门诊量8万，妇科年手术量达4000余例，同时承担厦门大学医学院的教学任务，在治疗妇科肿瘤、女性不孕症、子宫内膜异位症等疾病方面具有鲜明的专科特色，先后完成了腹腔镜下宫颈癌根治术、子宫内膜癌和卵巢癌手术分期术，腹腔镜下盆腔淋巴结清扫术、腹主动脉旁淋巴结清除术。
医生姓名：何方方
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
医生姓名：郭素清
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
医生姓名：王彦龙
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
医生姓名：赵梅
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
特需医疗服务区由厦门市妇幼保健院和国际优异的医疗机构——美国约翰斯·霍普金斯医院合作建立，以“家庭产房”的概念为本，引入世界先进的妇产科技术、医疗设备及管理模式，秉承追求优异的医疗服务的理念，以入微的关怀、精湛的医术，为孕、产妇及患者提供优质全方位产前、产时、产后一体化星级贵宾式医疗服务。
厦门市妇幼保健院儿童发育行为科成立于2002年6月，是福建省头家专门从事儿童发育行为疾病诊治的医疗保健机构。科室配备齐全，分设门诊和训练部两部分。现有工作人员23人，其中高级技术职称3人，中级技术职称7人，初级技术职称13人。
医生姓名：吴星东
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿科
医生姓名：谢辉
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿科
医生姓名：汪秀蓉
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿科
医生姓名：沈彤
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿科
儿童保健科是集儿童保健、疾病防治、科研及教学为一体的专业科室，是闽西南儿童保健业务指导、培训中心，它承担着全市儿童保健技术指导、培训、督导工作，负责厦门大学医学院儿少卫生与妇幼保健专业的教学工作。曾获得是市科学技术进步三等奖一项，世界卫生组织基金资助项目一项，近三年科室共发表及省级论文13篇。儿童营养与喂养指导专科为中国妇幼保健中心专科建设学科之一。目前拥有主任医师3人、副主任医师2人、主治医师3人、医师4人，主管护师3人、护师2人、保健护士3人，其中硕士研究生3人。
医生姓名：曾国章
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿童保健科
医生姓名：许立军
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿童保健科
医生姓名：王小林
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿童保健科
医生姓名：黄海莹
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：儿童保健科
我院小儿外科业务范围包括从新生儿到18周岁青少年的涉及腹部、头颈部、运动系统、泌尿系统、外科感染、创伤、烧伤、肿瘤和新生儿先天性畸形等及疾病类型。科室临床工作均由从事小儿外科医疗专业多年，临床经验丰富的医师担任，目前拥有主任医师1名、副主任医师1名、博士研究生1名，硕士研究生4名、主治医师3名，住院医师4名。
医生姓名：徐延波
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：小儿外科
医生姓名：黄国显
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：小儿外科
医生姓名：陈海琛
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：小儿外科
医生姓名：冯林
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：小儿外科
厦门市妇幼保健院新生儿科（NICU）是厦门市第三周期的重点专科，是福建省新生儿救护网络厦门市新生儿救护分中心。编制床位90张，占地面积1100m2，其中呼吸机抢救床位12张，每年收治患儿2800余人。技术力量雄厚，拥有医师20名，其中主任医师3名，副主任医师3名，主治医师4名，住院医师10名，其中硕士生7名；护理人员60名，其中主管护师5名，护师39名，护士16名。
由主任医师主诊，开展了耳疾病，包括外耳、中耳、内耳疾病的诊断治疗。依托本科技术力量建立的福建省厦门听力筛查诊断分中心，为新生儿、婴幼儿、儿童及成人提供听力、言语-语言疾病的诊断治疗、训练指导，助听器选配指导、听力障碍专科治疗、听力保健咨询等服务。该中心为市残联、劳动、公安等部门听力鉴定定点单位。
厦门市妇幼保健院口腔科- 综合 主要 承担妇女儿童口腔保健及口腔 疾病 的查治 工作 。 目前有口腔 副主任 医师 1名 ， 主治 医师 1名 ，并进一步吸纳了新生力量若干名 。 配备有：AM 8 0 5 0型口腔 综合 治疗仪 2台 ，光固化化机 2台 ，超声波洁牙机 1台 。
厦门市妇幼保健院眼科配备有日本进口裂隙灯、电脑验光仪、眼电生理、同视机、镜片度数测量仪等眼科检查仪器及弱视系统治疗仪。 儿童眼保健，对幼儿园儿童进行眼保健及斜视、弱视及屈光不正普查工作。在开展儿童斜、弱视及近视治疗、儿童眼保健方面有其特色。 厦门市妇幼保健院眼科主要承担我市幼儿眼保健、儿童视功能、先天眼病、外眼病普查普治及“幼儿屈光状态普查”，视觉诱发电位等电生理检查项目。
急诊科配备一支经过专业培训、技术精湛的急救医疗队伍，依托医院设备先进，技术力量强大的ICU、NICU，开展妇科、产科、儿科、新生儿等急救工作。科室按照三级甲等医院配备有抢救室、监护室、治疗室、急诊产房、妇产科诊室及检查室、儿科诊室、留观室等，抢救设施包括中心供氧系统、正负压吸引系统、PB840呼吸机、自动洗胃机、菲利浦除颤起搏仪和心电图机、迈瑞监护仪床边B超及X光摄片机等先进的仪器设备。为急危重症病人提供全方位高质量的服务，危重病例抢救成功率达90％以上。
厦门市妇幼保健院中医科包括中医妇科和中医男科，坚持“中西医并重”的理念，发扬独具特色的专科优势，采用现代医学检测手段，中西医结合诊治妇科和男科疾病。现有主任医师1名、主治医师1名（硕士研究生）、医师2名（硕士研究生）。
妇女保健科现有高级医师3名，中级医师3名，护士3名。 下设宫颈疾病诊治中心、青春期保健门诊、婚前保健门诊、更年期保健门诊、妇科疾病筛查门诊及艾滋病咨询门诊。
育龄夫妇生殖健康保健的重要业务科室，服务宗旨是：“婴儿健康，母亲安全”，围绕分娩前后即孕前、孕期、产时、产后各时期为孕产妇和胎婴儿提供医疗和保健服务，保护母亲和胎婴儿的健康，降低出生缺陷，提高人口素质。设有围产保健门诊、优生优育咨询门诊、产后康复门诊、孕产妇营养门诊。现有副主任医师3名，主治医师3名，医师2名，护理6名。配备先进的脐血流检查仪1台、胎心监护仪15台。
厦门市妇幼保健院林巧稚妇儿医院麻醉科担负着医院所有手术科室的麻醉工作及院内急救、疼痛治疗、相关会诊等工作。是集医疗、教学、科研于一体的装备有现代化麻醉、监测、急救设备的一个综合性临床科室。
是我院专业从事整形美容业务的科室，医院引进了具有世界先进水平的吸脂系统及激光治疗系统并引进具有丰富的整形美容临床经验的主任医生主诊，为广大患者及爱美人士带来了福音。
