上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心感染三科前身为公卫中心感染一科之血友病合并艾滋病病房，主要收治血友病合并艾滋病患者。2004年11月医院总部迁至金山后，血友病合并艾滋病病房一直留守在中心市区分部，目前在治患者共70名。为更好地服务于患者，2012年6月20日，正式成立感染三科，属独立建制，科室主要承担来自上海的全部血友病合并艾滋病患者的门诊和住院治疗工作。 感染三科自成立以来，先后由中心副主任卢洪洲、陈良直接分管科室管理。肖宏担任感染三科副主任（主持工作），同时为了加强科室对血友病合并艾滋病的治疗，更好地配合医院做好血友病患者的医疗工作，另聘请在艾滋病治疗领域经验较丰富的退休专家孙洪清主任医师担任科室顾问。 主持面授继续教育项目1项、承担上海市卫生局课题、国家科技部重大专项子课题各1项，参编著作6部。 作为上海市血友病合并艾滋病收治的少有定点医院科室，至今已收治80例血友病合并艾滋病患者，在治疗血友病合并艾滋病、艾滋病合并丙型肝炎治疗、ART药物不良反应的处理、艾滋病合并性传播疾病的诊治方面积累了丰富的临床经验, 赢得同行和患者的认可。
医生姓名：卢洪洲
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：感染内科
医生姓名：黄琴
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：感染内科
医生姓名：孙洪清
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：感染内科
医生姓名：王江蓉
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：感染内科
科室位于金山A3一楼和二楼，一楼为ICU 开放床位21张，二楼为普通病房，开放床位43张。呼吸内科将建一支技术精湛的专家团队。聘请上海市较优异的呼吸科医生担任中心临床呼吸科客座教授，目前拥有主任医生，副主任医生，主治医生，博士生多名。 在科研和人才培养方面，呼吸科依托本中心先进的的科研仪器与实力，在危重病学、慢性疾病以及肿瘤方面立志取得一些成果，在核心期刊发表文章；在人才培养方面主要采取送出去的培养方式，目前临床中心承担复旦大学，同济大学本科生，研究生临床实习基地瑞金、承担全国各地的临床进修。
消化科是以留学英国和美国哈佛大学哈佛医学院附属麻省总医院胃肠病学和肝病学系的专家程计林博士作为学科带头人，集临床医疗、教学和科研于一体，是由高级、中级技术职称医师和住院医师组成的一支有丰富经验的医生团队，并配有一支技术精湛的护士队伍。消化科门诊分为市区水电路门诊和中心本部门诊（金山区）；病房核定床位40张，有双人间，也可选用包间；市区和中心本部均有内镜中心、腹水浓缩回输室和臭氧治疗室，可以为病人提供无痛胃肠镜检查、上、下消化道出血的内镜下止血治疗及胶囊内镜检查，ERCP检查和治疗目前主要安排中心本部。
上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心普外一科是以引进人才, 博士生导师刘保池教授作为学科带头人，住院医师全部有硕士以上学历,还有一支技术精湛的护士队伍。组成了以诊治特殊感染外科疾病为专科特长，以国内首创的自体骨髓经门静脉输注治疗肝硬化为临床研究重点，以普通外科常见疾病为基础，除了开展甲状腺、乳腺、肠胃、肝胆外科手术,还可以为多学科的外科疾病患者提供手术治疗平台。普外一科的全体医师总结多年的临床经验,集体创作编写了国内首部《特殊感染外科学》。
胸外科于2014年7月1日在原外科胸外科组的基础上成立！ 成立时共有成员5人，其中主任医师1人，副主任医师1人，主治医师2人，住院医师1人 宋言峥主任2010年4月由河南省胸科医院胸外科人才引进至上海市公共卫生临床中心外科（详见简介）。随后外科分为普外科组和胸外科组，宋言峥负责胸外科组的日常工作。随着胸外科业务量的逐渐增大，经医院同意，设立胸外科，首任胸外科主任是宋言峥主任医师。
妇产科始建于1985年，是全国较早的肝病妇产科临床专科，主攻方向是产科肝病：妊娠合并各型肝炎、肝衰竭，妊娠期肝功能损害，妊娠肝内胆汁淤积症，妊娠急性脂肪肝，接受全国各地特别是长江三角洲地区的转诊和会诊。 是上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心的重点特色科室，国家教育部重点学科——复旦大学妇产科学的重要组成单位、上海市卫生局重点学科、上海市危重孕产妇抢救会诊中心（肝病为主）、上海市产科肝病监护中心。合作承担上海市第三轮三年行动计划项目“上海市艾滋病定点诊疗机构建设，目前已开展了合并感染性疾病（尤其HIV）的宫颈癌筛查诊治工作。
上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心儿科建科已有六十年的历史，是复旦大学附属医院优势学科传染病学专科之一，是全市少有收治母亲感染艾滋病病毒分娩婴儿的定点医疗机构。主要承担新生儿和儿童感染性疾病的临床诊治工作，主攻方向为阻断妊娠合并感染性疾病的母婴传播，尤其在阻断乙肝病毒、艾滋病病毒母婴传播及预防对围产儿的影响方面有着丰富的临床经验，并获得较好的效果。
本科室的临床及科研工作以传染病相关眼科、耳鼻喉科及口腔科疾病为主，在传染病相关眼病、耳鼻喉疾病、口腔科疾病的临床诊治方面积累了丰富的经验，如巨细胞病毒视网膜炎、眼部卡波西肉瘤、眼部淋巴瘤、HIV视网膜病变、结核性葡萄膜炎、梅毒性葡萄膜炎、视网膜血管炎、病毒性角膜炎、喉结核、艾滋病相关口腔病变等。为广大的免疫缺陷患者、结核病患者提供有效的个体化治疗，也为视网膜脱离、眼部肿瘤、喉癌等患者提供手术治疗，使广大患者的视功能得到极大改善，明显提高生活质量。
肝炎一科现位于上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心B1区二楼，核定床位40张。病区住院环境明亮舒适，设二人间病室，每病室内均有卫生间和冲淋房。患者入院时都会得到医护人员的详细环境介绍和就医指导。 本科技术力量雄厚，目前有医师13名，其中主任医师3名、副主任医师1名，主治医师3名住院医师6名。本科室的临床诊治水平和学术研究方面在国内肝病领域中具有良好声誉。长期以来以国外先进学术理念和丰富临床经验形成的精良医术赢得同行和患者的认可。本科致力于肝病领域的探索，进行新药临床研究已有十余年，参与多项国内外多中心临床试验，有序开展了活体肝组织学检查，为诊断和疗效判断提供依据。 本科室主要收治各类肝脏内科疾病，包括各类急、慢性病毒性肝炎，药物性肝损害、各类自身免疫性肝病，酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病，各种病因所致肝硬化、重症肝炎，及肝癌。尤其对慢性乙肝、乙肝肝硬化和重症肝炎抗病毒优化治疗，核苷（酸）类似物耐药管理和停药与复发管理颇有经验；对慢性丙肝、丙肝肝硬化和特殊人群丙肝干预颇有心得；亦擅长对重型酒精性肝病、自身免疫性肝病、各种肝硬化并发症的处理。
医生姓名：陈良
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：传染病科
医生姓名：王介非
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：传染病科
医生姓名：徐国光
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：传染病科
医生姓名：徐俊
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：传染病科
海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心结核科以卢水华为学科带头人，是上海市三所市级结核病定点医院之一和上海市少有的儿童结核病的定点收治医院。同时是教育培训基地、卫生部临床药物试验基地，是上海市公共卫生临床中心的重点专业，目前有正高职专家1名，副高职3名，主治医师5名，病房位于公共卫生临床中心A-1楼的二、三层，共有51张床位。 结核科承担了上海市结核病诊治和管理的重要任务，具有系统的结核病诊治和管理方案。收治病种广泛，擅长诊治肺结核、肺外结核（包括MDR-TB、XDR-TB）、非结核分枝杆菌病、全身疾病合并结核病、儿童结核病、播散性卡介菌病等。病员辐射全国各地，病种涉及继发性肺结核、非结核分枝杆菌病、血播、结脑、结核性胸膜炎、结核性腹膜炎、肠结核、肾结核、盆腔结核、淋巴结核、骨结核、皮肤结核；全身疾病合并结核病，如肝病合并结核病、糖尿病合并结核病、妊娠合并结核病等和肺部感染性疾病、慢性阻塞性肺病、自发性气胸、支气管哮喘、支气管扩张、肺脓肿、脓胸、肺部肿瘤等疾病的鉴别诊断及治疗。在2009年甲型H1N1流感及2013年H7N9禽流感的救治方面积累了宝贵的经验。
介入科特聘国内知名介入专家王建华教授为科室主任，袁敏副主任医师为执行主任，共有主任医师5名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师3名，其中博士6名，硕士2名，学士2名。在医疗上以王建华主任、袁敏执行主任领衔，依托我院“肝病临床中心”多学科综合治疗团队（MultiDisciplinary Team，MDT）诊疗模式，由肝胆外科、肝病内科、介入科、影像诊断专家共同商讨优异化的治疗策略，并以中山医院总院介入科先进、完善的介入治疗流程为标准，以肝脏良恶性肿瘤及血管性疾病多元化介入治疗为特色，为每一位患者量身定制个体化治疗方案，使患者得到较恰当的治疗及较大临床获益。开展肝脏良恶性肿瘤、血管性疾病、门脉高压、胆道、脊柱、妇科等专科疾病的介入治疗。
中医科是本中心重点学科之一。现有博士2人，硕士4人，本科4人，其中主任医师1名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师5名，研究员1名，额定床位40张。目前为“国家中医药管理局中医药防治新发突发传染病重点研究室暨临床基地”、“国家中医药管理局中医传染病重点专科建设项目”“国家中医药管理局中医药治疗艾滋病临床试点项目”、 “上海市中医药发展三年行动计划（中医药防治艾滋病及新发突发传染病基地建设）项目”、“上海市中医临床优势专科（慢性重型肝炎）”、“上海市综合医院中医科达标建设项目”。
