1985年毕业于中国人民解放军第一军医大学,获医学学士学位。于1995年毕业于北京大学医学部,在该校完成住院医师规范化培训,获得儿科学硕士学位。1998年-2001年,在重庆医科大学附属儿童医院担任儿科总住院医师,并继续攻读博士学位,于2001年获得儿科学博士学位。姚慧臣医生有近30年儿科临床经验,曾先后任职于中国人民解放军第二五一医院、二六一医院和北京王府中西医结合医院儿科,先后发表超过30篇儿科医学论著。