杨慧琪医生毕业于天津医科大学，获医学学位，后在荷兰格罗宁根大学医疗中心攻读肝胆外科博士学位，获取博士学位。杨医生曾任澳大利亚弗林德斯大学医学院讲师。杨医生在天津医科大学附属南开医院（急腹症专科医院）完成住院医师培训，随后担任4年外科住院医师及3年微创外科中心主治医师，并晋升为副主任医师。2010年初，她取得在澳洲的行医执照，在澳大利亚弗林德斯大学附属医疗中心普外科工作。她曾获得与澳洲新西兰减肥外科协会主席一起工作的机会，在澳大利亚阿德雷德减肥外科中心作为减肥外科医生工作一年。在这段时间内，她积累了二百余例腹腔镜减肥手术的经验（尤其是腹腔镜胃束带术）。通过多年的外科临床工作，杨医生在普外科、腹部外科尤其是腹腔镜外科领域积累了丰富的经验，独立完成各种腹腔镜手术千余例。 她尤其擅长腹腔镜胃底折叠术（治疗严重的胃食管反流性疾病）、腹腔镜食道裂孔疝修补术（治疗巨大食道裂孔疝）、腹腔镜阑尾切除术、腹腔镜胆囊切除术、腹腔镜疝修补术和腹腔镜胃束带术（减重手术），并且开展单孔腹腔镜手术以满足患者美观的需求。杨医生在国内外多本学术期刊上发表过文章，并多次参加国际学术会议交流，多次被邀请为讲师培训腹腔镜手术，尤其是腹壁疝修补手术和食道裂孔疝修补术。此外，杨医生承担国家青年自然科学基金一项，题目为：肝胆运输系统在胆道闭锁肝纤维化进展过程中的作用。