变态（过敏）反应科是中国临床变态反应学的发源地和摇篮。经过几代人的努力，已逐渐成为中国变态反应学科的医、教、研中心，在过敏反应性疾病的诊断、治疗及基础研究方面居国内先进水平，在国际也有一定影响。北京协和医院变态反应科在中国老百姓心中享有较高的声誉，看过敏性疾病去协和医院变态反应科已成为全国过敏性疾病患者的共识。2009年该科的门诊量接近7万人次 高峰季节日门诊量近350人次，患者大部分来自全国各地。
医生姓名：白纯政
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：变态反应科
医生姓名：文利平
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：变态反应科
医生姓名：李宏
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：变态反应科
医生姓名：支玉香
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：变态反应科
医疗工作（疑难感染性疾病的诊治）：病房收治的疑难病例中主要包括不明原因的发热待查住院病例（300例/年），中枢神经系统感染住院病例（30例/年），AIDS门诊新病例和住院病例（50例/年）及其他各种病因的感染病例。病房年收治病人数约为450人次；病床使用率为99.2%；门诊工作量（包括肝炎门诊）近20,000人次；临床实验室承担全院有关传染病血液标本（包括肝炎病毒核酸PCR检测、T淋巴细胞亚群、莱姆病抗体及结核特异的淋巴细胞培养+干扰素测定的检测工作。
呼吸内科是由我国已故知名呼吸病学专家 - 朱贵卿教授创建的、具有悠久历史的学科专业，是我国较早成立的呼吸科专业科室之一，是我国优异的呼吸科学临床和研究中心及呼吸疑难病诊治中心，拥有众多的我国呼吸专业的老前辈或知名教授。朱贵卿教授、罗慰慈教授、朱元珏教授、黄席珍教授、林耀广教授、李龙芸教授、蔡柏薔和陆慰萱教授等都曾或正在这里执教和工作。
医生姓名：林耀广
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：呼吸内科
医生姓名：韩江娜
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：呼吸内科
医生姓名：钟旭
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：呼吸内科
目前内分泌科现有工作人员79人，其中工程院院士1名，教授7名、副教授7名，主治医师18名，住院医师2名；研究员1名、副研究员4名，研究实习员1名，副主任技师1名，主管技师8名、技士1名，中级职称管理人员1名，主管护师9名、护士18名。目前病房有床位66张。在医疗方面内分泌科每年门诊诊治来自国内外的患者10万人次左右，每年收住院1300人次左右。许多疑难重症患者在这里得到了正确诊治，为此国际知名的内分泌学家J.D.Wilson教授特别撰文称：“北京协和医院，一座蕴藏内分泌财富的殿堂”，发表在国际知名学术期刊（J Clin Endocrinol Metab 1992）上。我科是国内目前分支学科较全面的内分泌学科，设有糖尿病、垂体、甲状腺、肾上腺、内分泌高血压、代谢性骨病和肥胖7个研究组。内分泌科学术梯队合理、阵容强大。多年来内分泌科在科研上取得了丰硕的成果，每年有50余篇科研论文发表，曾获得国家科技进步一等奖1项、二等奖2项、三等奖1项和多项卫生部科技奖励。
医生姓名：伍学焱
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
医生姓名：李梅
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
医生姓名：连小兰
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
医生姓名：卢琳
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：内分泌科
神经科成立于1921年，光阴似箭，岁月如梭，历经90余载风雨，北京协和医院神经科已经成为全国久负盛名的神经专科，科室专业设置齐全，技术力量雄厚，是国内较早的神经病学专业博士、硕士学位授予点及博士后工作站之一。在处理和解决疑难杂症和重症方面处于国内领跑地位 。现拥有11个专业组（临床神经生理、脑电图与癫痫、痴呆与认知障碍、脑血管病、帕金森及运动障碍、神经病理、神经肌肉病、感染与脑脊液细胞学、神经免疫、神经遗传和睡眠），开设9个特色门诊（神经肌肉病门诊、肌张力障碍和肉毒毒素治疗门诊、帕金森病和老年痴呆门诊、癫痫门诊、脑血管病门诊、运动神经元病、重症肌无力门诊、多发性硬化门诊和头痛门诊等），为广大患者提供高水平的医疗服务。
医生姓名：彭斌
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
医生姓名：李晓光
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
医生姓名：刘明生
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
医生姓名：高山
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
1979年肾脏病在中国作为一个崭新的学科才刚刚起步,毕增祺教授有远见的创立了北京协和医院内科肾脏病专业组，成为中国较早的肾脏内科之一。1980年起建立了肾脏病实验室和血液透析室。九十年代初期，一批年轻的学者从海外学成归来，为肾脏病临床、教学和研究注入了新的活力和发展契机。1993年北京协和医院内科肾脏病专业组和其他各专业组一样，都改为学科即肾脏病科，同时成立了血液净化中心。90年代后期，多位博士、硕士研究生毕业，并相继赴美国、欧洲、澳大利亚和日本完成博士后训练或进修归来，使得肾内科更具生机和活力。经过近30余年艰苦创业，协和肾内科已逐步发展成为现代化的肾脏病诊疗中心，包括肾脏病门诊、病房、血液净化（包括腹膜透析）中心、和肾脏病实验室。
消化内科有着悠久、辉煌的历史，1933年张孝骞教授创建了消化专业，20世纪70年陈敏章教授创建了消化内镜中心，继20世纪60年代成立硕士生培养基地，先后成立博士生培养点（1982）和博士后流动站，2000年以单学科（16医生）挺进/荣获教育部重点专科（其中消化领域共5家，其余4家均为联合申请）至今，2006年仍然以单学科成功卫冕教育部重点专科；2011年再次成为卫生部重点学科之一。协和消化内科有完善的科室发展规划，在临床工作中严格执行医院ISO9001质量认证。依托医院综合平台，在大内科、免疫内科、基本外科、内分泌科、放射科、病理科、核医学科、超声科等兄弟科室的大力支持下，使得我科医疗水平、诊治能力进一步向前推动。
医生姓名：吕红
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：消化内科
医生姓名：朱丽明
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：消化内科
医生姓名：刘晓红
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：消化内科
医生姓名：陆星华
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：消化内科
协和医院心内科具有悠久的历史。早在中华人民共和国成立初期，由黄宛教授和方圻教授组建了协和医院内科心组，率先在国内开展了心血管专科的临床和研究工作。50年代初期，黄宛教授等从修复三导联的弦线心电图机开始到制造出十二导联心电图机，为心电图在我国的普及做出了巨大的贡献。50年代末期，在黄宛和方圻教授的领导下，心组在国内率先开展了右心导管和血液动力学监测。在1958年北京阜外医院成立初期，黄宛、方圻、陈在嘉、吴宁教授等由协和医院心组调往阜外医院，为我国心血管专科医院的创立做出了贡献。
血液科具有悠久的历史，是我国现代血液学的先驱者，也是我国培养血液学专业人才的较早基地。1932年北京协和医学院内科率先在我国建立了一个血液学专业实验室，并于1934年建立血液内科专业组。1980年成立大内科建制下的血液内科。1981年经教育部批准为博士生培养基地。1990年被国家教委认定为血液学国家重点学科点（与医科院血液学研究所联合）。1992年成为博士后流动站。2006年被卫生部及北京市批准为首批血液内科专科医师培训基地。 血液科自建立专业组起即清醒地认识到血液学专业组是大内科中的一员，是综合性医院的一个重要组成部分。我们的临床工作重点要面向全内科、面向全院，即要研究原发的血液病，也要重视研究其他专业患者面临的各种血液学问题，这就是北京协和医院血液科的特色和长期努力的方向。
骨科的前身是北平协和医学院骨科，创立于20世纪20年代，是我国优异的骨科学临床和研究中心，许多我国外科学界骨科专业的老前辈，如孟继懋教授、王桂生教授、吴之康教授、王福权教授、宋献文教授等都曾在这里执教和工作过。现任主任是我国知名骨科学专家、中华医学会骨科分会主任委员邱贵兴院士。
泌尿外科始建于二十世纪四十年代。50年代由老一辈医学家虞松庭、吴阶平、施锡恩创建了一定规模的专科。60年代至80年代刘国振、吴德诚、臧美孚等专家教授将其发展成为国内知名的泌尿外科专业科室。在协和“严谨、求精、勤奋、奉献”院训的激励下，经过几代人数十年的努力，目前已发展建设成为国内优异的具有肾上腺外科、腔道微创外科、肾移植、泌尿系肿瘤、普通泌尿外科、男科学等专业领域的科室。
基本外科在我国医学史上有着辉煌的业绩，涌现出很多全国甚至国际闻名的医学专家，比如曾宪九、朱预、费立民、蒋朱明、钟守先、赵玉沛教授等。基本外科成立于1921年，是与我院院龄相同的核心科室之一。自20世纪80年代以来，在历任主任及学科带头人的领导下，根据基本外科的特点，在国内较早细化建立专业组：包括胰腺、胆道、胃肠、血管、乳腺、肝脏、外科营养、重症及相关临床专业实验室。经过几十年几代人的不懈努力，现拥有158张病床及2个分子生物学实验室，已成为普外领域全国疑难重症疾病的诊治中心，拥有结构合理、素质优异的人材梯队，多名专家在中华医学会和国内外杂志担任各种领导职务。在胰腺疾病、胃肠疾病、胆道疾病、肠外肠内营养等临床与科研领域独具特色，部分研究处于国内、国际先进水平。
乳腺疾病是妇女中的常见病，乳腺癌在我国城市地区已占女性各类肿瘤发病率的一位，是严重危害广大妇女健康及生命的恶性肿瘤。北京协和医院乳腺专业组，是在20世纪80年代由我国外科奠基人之一曾宪九教授提议，并在他的支持和帮助下成立的，黄汉源教授任专业组长。在黄汉源教授的领导下，乳腺专业组不断发展壮大，创造了良好的社会效益和经济效益，为了更好的为病人服务和学科的发展，在医院领导的关心和支持下，2006年2月将乳腺专业组扩大为北京协和医院乳腺外科，孙强教授任主任。
医生姓名：孙强
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：乳腺外科
医生姓名：张晓辉
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：乳腺外科
医生姓名：关竞红
综合评分：4300
医生资格：主治医生
科室细分：乳腺外科
整形外科始建于1952年，由中国整形外科创始人之一的宋儒耀教授担任主任。1957年整形外科脱离协和医院，历经扩建、迁移及解散。60年代末，北京协和医院恢复整形外科，仍由宋儒耀教授领衔。1979年，再次脱离协和医院，扩建为整形外科医院。为与国际接轨，提高综合实力，创建较高级水平的综合医院，北京协和医院于2003年再次恢复整形外科。目前为中华医学会整形外科分会常委及中国康复医学会修复重建外科分会常委所在单位，国家整形外科重点专科单位。现任主任王晓军教授。
擅长处理妊娠合并急危重症以及疑难内外科合并症，建立了高危孕产妇重症监护病房（ICU）和新生儿重症监护病房（ICU），降低了孕产妇和围产儿死亡率。建立了我国一个产前诊断实验室 ，研究并发展出一整套胎儿取材方法：羊膜腔穿刺、经腹早孕绒毛活检、脐静脉穿刺、胎儿镜检查等。开发和应用新技术：外周血染色体制备、羊水染色体制备、绒毛染色体制备、产前筛查、某些遗传病的基因诊断、某些代谢病的生化指标检查、外周血、羊水和绒毛细胞分析等
医生姓名：高劲松
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：产科
医生姓名：马水清
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：产科
医生姓名：刘俊涛
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：产科
医生姓名：宋英娜
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：产科
进行了子宫内膜异位症的发病机制和临床治疗；女性盆底功能障碍性疾病的基础与临床研究；广泛深入的开展了妇科内窥镜和微创手术的临床研究；宫颈病变的规范化治疗，首先应用薄层液基细胞学技术、TBS报告系统和HC-II检测HPV 进行宫颈病变的筛查；提出宫颈病变诊断的“三阶梯”模式；深入的探讨宫颈锥切在诊治宫颈上皮内瘤变的价值。
医生姓名：向阳
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
医生姓名：史宏晖
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
医生姓名：冷金花
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
医生姓名：金力
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：妇科
儿科发挥综合医院多科协作的整体优势，在疑难病诊治方面在国内儿科系统享有盛誉；肾脏病、自身免疫性疾病的诊治方面有突出特点；新生儿专业实力雄厚，依托协和医院围产中心，在危重新生儿的急救与转运、早产儿尤其极低出生体重儿的管理与随访等方面居领跑地位；与医科院基础所遗传室和协和医院妇产科合作组建的遗传中心，能为多种遗传病做产前基因诊断与咨询；其它如消化、呼吸、血液专业等均有迅速发展；PICU与心胸外科、神经外科、骨科等科室合作，负责手术患儿的监护与治疗；在国内较早开展高危儿的系统管理与早期干预，积累了丰富的早教经验并在不断完善，使协和医院儿科真正成为提供全方位医疗服务的综合性儿科。
耳鼻咽喉科是北京建立较早的耳鼻咽喉科， 1916年设眼耳鼻喉科，1921年耳鼻喉科成为独立的科室。我国知名的耳鼻喉科专家刘瑞华、李宝实、胡懋廉、郎健寰、张庆松、徐荫祥、林必锦先后在该科工作。1930年就有了电听力计和前庭功能试验设备。早在1938年张庆松教授就开展了变态反应临床业务。建国后张庆松、徐荫祥、卜国铉、哈献文、秦廷权、邹路得、王直中、屠规益、汪磊、叶世泰、顾瑞金等先后在该科工作。
肿瘤内科是一个年轻的、朝气蓬勃的科室，前身为2001年11月建立的肿瘤化疗病房，2002年8月独立建立科室。目前，学科有专业组教授2名、副教授3名、高年主治医师8名、低年主治医师3名。16名医师中，博士学位11人、硕士学位5人，医生队伍已形成了老中青均衡发展的梯队。其中所有医师、护士长为中华医学会临床肿瘤学会会员。目前，陈书长教授担任《中华肿瘤杂志》、《中华误诊医学杂志》、《癌症进展杂志》编委，为CSCO委员，CGOS常委。白春梅教授为CSCO委员，CGOS委员，中国抗癌协会胃癌专业委员会委员，担任《中华临床营养杂志》编委，《中国新药杂志》审稿人。陈书长教授为肿瘤内科主任。现任科主任为白春梅教授。
经过90年代的扩建以及多年来的设备更新、人才引进，加之东、西两院的合并，口腔科不断发展壮大。随着学科的发展，进一步完善了专业组设置，现设有口腔颌面外科学专业组、牙体牙髓病学专业组、牙周病学专业组、口腔黏膜病学专业组、儿童口腔病学专业组、口腔修复学专业组、口腔正畸学专业组以及口腔种植中心、无痛牙科治疗中心等七个专业组和两个治疗中心。目前的口腔科已成为拥有近51台口腔综合治疗台、12张病床、76名医护人员（包括医生48名、护士19名、技术人员9名）的大型科室。在职博士生导师1人，硕士生导师5人。学科人才梯队趋于合理，其中教授和主任医师6人、副教授和副主任医师11人、主治医师24人、住院医师 7 人。
眼科成立于1920年，是我国较早成立的眼科。成立后许多国际优异的眼科学家曾在这里主持工作，被誉为“东方的维也纳眼科中心”。经过90年的发展，协和眼科成为专业齐全，融医、教、研为一体的眼科基地，整体水平在国内处于领跑地位，一些项目达国际先进水平。协和眼科是国内首批硕士、博士学位培养点和博士后流动站，首批住院医师规范化培训基地。
皮肤科在我国是较早的皮肤性病学科之一，成立于1924年，首任主任是Dr. Chester N. Frazier。解放后一直由我国皮肤性病学奠基人之一、知名的皮肤性病学家、一级教授李洪迥任科主任。经过近一个世纪来几代人的不懈努力，皮肤性科学科队伍不断壮大，在医疗、教学、科研等方面取得了突出的成绩，为我国的皮肤病、性病学发展做出了突出贡献。皮肤性病科为国家重点学科、博士生及硕士生培养点。现有专家、教授16人，其中10名离退休教授仍然参加门诊、会诊与保健等医疗工作。在职职工47名，其中教授6名，副教授6名，主治医师10名，住院医师3名，技术员5名，护士16名。经过90年几代人的努力，我科已经成为设有普通门诊、性病门诊、激光中心、皮肤美容治疗中心、保健与特需门诊、急诊、病房、研究室等的大型皮肤性病科室。拥有一支勤奋好学、朝气蓬勃、年富力强的医护队伍。科内拥有先进的仪器、设备，为临床诊断、治疗、教学和科研等工作提供了良好的物质条件。
随着社会对心理健康的关注和需求不断增加，北京协和医院心理医学科重组成立于2006年5月。我科采用预约就诊制，心理治疗与药物治疗结合。为受心理或情绪困扰的来访者、为因心理疾病产生情绪问题或身体的功能性症状难以缓解而苦恼的患者、为慢性或严重疾病在心理上承受折磨的患者及家属提供帮助。学科创建人及带头人魏镜教授从事综合医院内精神/心理专业工作20余年，在临床及学术领域享有盛誉。
中医办公室成立于1955年，1961年正式命名中医科，当时由知名中西医结合专家史济招教授担任科室负责人。曾聘请北京四大名医之一施今墨，知名中医学家任应秋、陈慎吾、钱淇光、李重仁等为顾问。1979年聘请北京四大名医施今墨的入室弟子知名中医祝谌予作为中医科主任。几十年来全科以中西医结合为学科建设和发展的主要方向，开展医教研工作，培养了大批的中西医结合的骨干人才。2002年成为北京市综合性医院示范中医科；2007年被批准为“十一五”期间北京中西医结合糖尿病特色诊疗中心和国家中医药管理局重点糖尿病专科；2007年被评为全国综合性医院中医药示范单位；2011年评为卫生部重点学科（中医内分泌）；曾多次被评为北京协和医院先进集体。
营养科是我国成立较早的医院营养科，是医院1921年建院之初就存在的6个科室之一，有着悠久的历史。是我国临床营养人员的培训基地和成长摇篮，几十年来为我国培养了大量临床营养专业人才。营养科现有专业人员9名，其中正高职称2名；副高职称1名；中级职称5名；初级职称1名。承担了协和医院住院患者的营养会诊及营养配餐；门诊患者的咨询指导；协和医科大学护理系本、专科和继教学院营养学教学；与营养相关的科研；大众的营养健康科普宣教等工作。
健康体检中心于2005年成立。分东、西两院体检中心。中心充分依托协和医院的综合实力和品牌影响，整合了医院强大的专家人力和设备资源，努力打造高品质的健康管理服务平台。
