新华医院崇明分院呼吸内科是治疗支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病（慢性支气管炎、肺气肿）、肺心病、呼吸衰竭、肺癌、阻塞性睡眠呼吸暂停综合症（鼾症）、肺病感染、胸腔积液、气胸、肺间质纤维化、肺栓塞及其他肺血管疾病的专科。共有床位60张，其中呼吸重症监护病房5张病床，设有肺功能室、睡眠呼吸监测室。有主任医师1名，副主任医师1名，硕士生导师1人。除开设呼吸科普通和专家门诊外，尚开设慢阻肺哮喘专病门诊、戒烟专病门诊等。拥有电子支气管镜检查系统、呼吸睡眠监测仪、肺功能仪、多种有创/无创呼吸机等医疗设备。
医生姓名：罗勇
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：呼吸内科
医生姓名：宋志芳
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：呼吸内科
医生姓名：陆惠昌
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：呼吸内科
上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院老年医学科成立于2010年（前身为干部保健科，成立于上世纪80年代）。目前，科室常设床位46张，现有医师3名，包括主任医师2人，高年主治医生1名。其中硕士生导师1名，博士1名、硕士1名。学科在临床内科各专业的基础上，以从事老年期疾病的诊治、监护、预防、提供高质量的医疗保健服务为特色，以开展衰老相关的生命科学研究、培养高层次老年医学人才为宗旨，先后承担了国家自然科学基金、卫生部课题、上海市科委项目、崇明县科委基金等科研项目，主要研究方向包括：老年血液疾病、老年心、脑血管疾病诊治、老年糖尿病及骨质疏松症的防治、慢性阻塞性肺疾病、多脏器功能衰竭的治疗等。
新华医院崇明分院内分泌科共有床位22张。科室由12名护士和8名医师组成，其中主任医师1名，副主任医师2名，主治医师5名，博士1名，硕导1名，硕士（包括在读）5名。平均每年收治1000余例住院患者，目前年门诊量已超过50000人次。
医生姓名：秦利
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：内分泌科
医生姓名：石群
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
医生姓名：顾红霞
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：内分泌科
新华医院崇明分院神经内科创建于1980年，集医疗、教学、科研为一体，是医院重点扶持学科，目前开设床位24张（2013年底增加至一个半病区70张病床），病区设置有重症监护室、神经康复治疗室、神经电生理检查室等治疗病房和功能诊断室，仪器设备先进。目前有医、技、护各级专业技术人员31名，其中教授/主任医师1名，副主任医师3名，硕士研究生导师1名。
医生姓名：王文安
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
医生姓名：沈亚雯
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
医生姓名：邱超
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
医生姓名：朱宗飞
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
上海市新华医院崇明分院（崇明县中心医院），创建于1915年，是上海市崇明县少有的一所三级乙等医院。2010年以来，我院列为上海市政府卫生事业发展 “5+3”工程，得到了新华医院总院的全面托管，来自新华医院主要临床科室和行政部门的30多位专家长期驻扎院内，指导和管理各个学科的临床、教学和科研，同时也吸引了全国各地的专门人才的加盟，整个医院的规模、技术水平取得了长足发展。
医生姓名：胡颖
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：消化内科
医生姓名：王鸿
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：消化内科
医生姓名：黄敏
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：消化内科
医生姓名：周友发
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：消化内科
上海交通大学医学院附属新华医院(崇明)心血管内科，是医院重点建设学科之一。学科确立的主要研究方向有缓慢型心律失常的起搏治疗，冠心病的介入优化治疗，快速型心律失常的非药物治疗，高血压和心衰的慢病管理四个主要研究方向，近年来在坚持医、教、研紧密结合，床边心脏病学介入心脏病学相辅相成，整体快速全面发展，科室学术地位和社会声誉日益提高。 目前科内拥有普通床位70张、监护床位15张。年出院3500余人，年门诊量7万人次。目前全科共有医护人员57名，心血管内科实力雄厚、人才济济，包括主任医师5名、副主任医师4名，博士生导师2名，主管护士7名，主管技师及技师6名。
医生姓名：陆秋芬
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
医生姓名：张亚臣
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
医生姓名：窦存芳
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
医生姓名：杨德威
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
目前我科共有医师6名，高级职称2名，中级职称4名，其中硕士学历3名：护士10人，中级职称3人，初级职称7人，床位数24张，年收治患者800余人次，年门诊量约10000人次。 作为岛上少有的血液内科，对淋巴瘤、急慢性白血病、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合症，骨髓增殖性肿瘤、出凝血疾病、贫血以及白细胞、血小板减少的诊治，积累了丰富的临床经验，在全岛赢得了良好的口碑。近年涉足免疫风湿科领域，对类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、白塞氏病、干燥综合症等疾病的诊治也取得了一定的临床经验。
医生姓名：陈大伟
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：肝胆外科
医生姓名：高伟陈
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：肝胆外科
医生姓名：施兆发
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：肝胆外科
医生姓名：黄侠
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：肝胆外科
骨科为院、县重点学科，上海市医学重点专科。开放病床90张，医护人员40余人，主任医师3人，副主任医师3人，主治医师5人（其中博士3名、硕士8名，硕士生导师2名）。拥有专用防射线、百级、千级净化手术间3间、进口手术移动X线机多台，以及进口关节镜、手术显微镜及多功能手术床等先进骨科设备，设备总额800多万元。年门急诊6万余人次，手术2500余人次，出院达4000人次。主持市卫生局以上课题4项、上海交大医学院科研课题2项，县级课题10余项，发表专业论文20余篇，获专利2项。
医生姓名：陆骅
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：宋烜
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：王立新
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：俞思明
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：骨科
上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院泌尿外科是崇明县重点学科，科室核定床位46张，科室现有医师10名，其中主任医师1名，副主任医师3名，主治医师3名，住院医师3名，博士硕士学历医师各一名，另外新华医院派遣长驻专家1名。 科室分三个亚专业组：尿路结石组，前列腺疾病和先天畸形疾病组，泌尿系统肿瘤组。分别由相关医师主要负责相应疾病的诊断，治疗和随访复查，使不同疾病能够得到专业医师的精心治疗和跟踪随访，使病患得到系统完整治疗。
医生姓名：陈建华
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：泌尿外科
医生姓名：刘洪新
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：泌尿外科
医生姓名：王乾
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：泌尿外科
上海交通大学医学院附属新华医院(崇明)心胸外科于2009年通过医院科室结构调整成立，目前能对除体外循环心脏手术以外的所有心胸血管外科疾病进行手术和介入治疗，尤其在胸部创伤、肺癌、食管癌、贲门癌、纵膈及胸膜、胸腔镜手术等胸部疾病的外科治疗领域具有显著的特色和优势。科室设有病床20张。现有教授、主任医师1名，副主任医师2人、主治医生2人。
医生姓名：王明松
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：胸外科
医生姓名：徐方杰
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：胸外科
医生姓名：陆善伟
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：胸外科
医生姓名：李杰
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：胸外科
妇科拥有悠久历史，是医院重点扶持科室，负责崇明地区几十万妇女的妇科疾病诊治和防控工作，承担妇科疾病质量控制和危重病人抢救工作，使得岛内居民做到不出海岛也能解决所有的妇科常见疾病。2012年，妇科作为重点专科顺利通过三级医院的评审，科室的医教研水平得以全面提升。由新华医院妇科主任张萍教授兼任崇明分院妇科主任，新华医院派驻王梅主任担任妇科执行主任并常驻崇明。目前妇科拥有病床46张，医护人员23名。医生11人，其中博士1人，在读硕士3人，主任医生1人，副主任医师3人。具有腹腔镜、宫腔镜、阴道镜、利普刀等先进设备。
儿科包括病房、急诊、门诊三个部门，现有医师17人，其中高级职称8人，中级职称6人，初级职称4人；护士20人，其中主管护师3人，护师10人，护士7人；研究生学位1人，在读研究生学位3人。病房床位共53张（其中新生儿监护14张）。儿科每年门急诊量7.5~8.5万人次，住院病人2700~2900人次。多年来，医护人员坚持不断进取，临床诊治水平逐年提高，在崇明地区位居一位。经过几代人的奋斗，儿科医师具有良好工作能力和素质，具备呼吸，神经，免疫和新生儿等多个专业的临床经验，在新生儿、哮喘、癫痫、学习困难和过敏性疾病诊治等方面形成特色。
医生姓名：刘晓青
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：儿科
医生姓名：施彩萍
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：儿科
医生姓名：李冬
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：儿科
医生姓名：谭永强
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：儿科
新华医院崇明分院儿童保健科创建于2003年，是一支专业医疗保健团队，可为0-14岁儿童提供全方位的保健服务。在新华医院儿童保健科专家支持下，我院儿童保健科致力于保障和促进儿童身心健康 跟踪国际前沿的研究进展 并应用于临床实践，以生长发育、儿童营养、儿童心理与行为发育的评价与干预为重点。专科医师先后去美国、上海新华医院、上海儿童医学中心等地进修学习。
耳鼻咽喉科目前共有医师 7 名，其中主任医师2 名，主治医师 3 名，住院医师2 名，主管护师 2 名，护师 3 名。 自2010年起，经县政府和医院的大力投入，在新华总院的支持下，引入了大批的先进设备，使科室目前的检查项目和常见病的治疗基本达到“三级医院”的要求和水平。能够满足岛内居民日益增长的医疗需求和疾病的诊断、治疗。
上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院肿瘤科是集医、教、研和预防为一体的肿瘤综合诊疗机构、上海市少有国家卫计委 “市、县级医院常见肿瘤规范化治疗示点单位”、国家卫计委首批“癌痛规范化治疗示范病房”、上海市卫计委肿瘤学重点专科、全国县级医院头家国家食品药品监督管理局肿瘤药物临床试验基地 、上海大学生命科学学院医药转化研究基地、上海市疾病预防控制中心肿瘤四位一体防控崇明地区治疗单位、上海市崇明县卫生局重点学科、上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院重点学科。
新华医院崇明分院口腔科目前拥有8名专科医生，其中主任医师一名，副主任医师一名，主治医师2名，拥有牙科综合治疗仪9张，数字牙片机，口腔全景片机，进口高压消毒炉等先进设备。临床设有口腔颌面外科、口腔修复科、口腔内科、口腔正畸科等专业学科。
上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院眼科是上海市白内障复明工程定点医院，年门诊量约3万余人次，年住院手术量近1000台，普通病房床位7张。
上海交通大学医学院附属新华医院崇明分院皮肤性病科是崇明县成立较早的皮肤病与性病诊疗科室，经过几代人的艰苦努力，目前已成为集医、教、研于一体，诊疗规范，治疗手段比较齐全的皮肤病专科，也是经上海市疾病控制中心认定的性病规范化治疗门诊。门（急）诊量逐年增加，2012年已达近5万人次。 除担任临床医疗任务外，还负责安徽医科大学、蚌埠医学院实习生的皮肤病学教学，包括课堂上课、示教及临床学习。
新华医院（崇明）康复医学科是崇明县较早建立的康复医学科之一,随着新华崇明医疗联合体的成立，康复医学科不断发展壮大，尤其是近两年取得了长足的进步。医师梯队拥有硕导1名，正高1名，副高1名，康复治疗师5名，全面开展了儿童和成人神经系统、骨骼肌肉系统等多种疾病的康复医疗、教育、科研工作。
伤科是我院治疗颈肩腰腿痛为主的特色专科。如腰椎间盘突出症，椎动脉型、神经根型颈椎病，。目前科内具有较先进的电脑腰椎牵引床、颈椎牵引椅、中药熏蒸床、微波治疗仪、红外线治疗仪、激光半导体、中医定向透药疗法。共有23张床位。已具有一定的规模，在社会上有较好的影响。科内目前有6名主治医师为主的技术队伍。
由李嘉诚基金会捐资的上海宁养院2001年6月20日诞生于上海交通大学医学院附属新华医，该慈善医疗服务机构主要为为肿瘤晚期贫困患者免费提供上门巡诊、免费镇痛治疗和症状控制及心理辅导。迄今已为近五千名晚期肿瘤患者提供了全方位的专业服务，在接受服务的这些患者中，既有上海本地居民，也有外地来沪工作的新上海人，还有落叶归根、海外归来的华侨、台属，其中年龄较大的96岁，较小的2岁。
