呼吸科对呼吸系统常见病、多发病、疑难、急危重病人的诊断、治疗、抢救达到国内先进水平。可进行支气管镜检查、肺活检、支气管肺泡灌洗术、吸痰、镜下止血和各种镜下治疗；可对鼾症病人（睡眠呼吸暂停综合症）进行睡眠呼吸多导监测，同时进行阻鼾器和无创通气治疗；肺功能检查；机械通气治疗；对吸烟人群进行健康教育并协助戒烟治疗；对多种吸入性物质和食物进行过敏原检测。
内分泌科主要开展糖尿病与糖尿病急慢性并发症的诊断及治疗，各类甲状腺疾病、垂体、肾上腺疾病、骨代谢疾病、痛风、性腺疾病及继发性高血压病的诊断治疗。 每月定期开展糖尿病患者教育，由科主任或主治医师以上医师担任讲课工作。自科室成立以来长期承担新疆医科大学、石河子大学的临床教学工作。同时承担自治区全科医师内分泌专业的教学与临床实习工作。 2002年引进胰岛素泵强化血糖控制，提高了糖尿病患者急性并发症的治愈率，缩短了糖尿病患者围手术期的准备时间，改善了术中、术后的血糖控制情况，更有利于手术病人的恢复。
医生姓名：艾隽
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
医生姓名：程瑞雪
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：内分泌科
医生姓名：杜琳
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：内分泌科
医生姓名：谢梅
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：内分泌科
神经内科主要治疗神经系统常见病、多发病。如脑血管病变（中风）、中枢神经系统感染、癫痫、脊髓炎、周围神经病变、肌肉病变等。特别是对各种急、慢性脑血管病的治疗形成了独具特点的治疗体系，不论是“中风”病人的急性期抢救，还是恢复期的康复都有比较完整系统的治疗手段。
医生姓名：李永杰
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
医生姓名：刘广志
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经内科
医生姓名：巴哈尔古力·亥衣台木
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
医生姓名：刘毓
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：神经内科
乌鲁木齐市友谊医院肾病科成立于九十年代初，是全疆较早开展肾病专科之一，是乌鲁木齐地区肾病治疗中心。在老一辈肾病专家的辛勤努力下，肾病专科不断发展壮大，已成为集医疗、教学、科研于一体，全疆较大的肾病治疗中心之一。
消化科开展了对消化系统常见及疑难病症的诊断治疗及内镜诊断治疗。主要收治食道、胃、肠道、肝脏、胆囊、胰腺、腹腔内各种疾患为主的病人，如各级反流性食道炎、急慢性胃炎、消化性溃疡、各种类型肠炎、各种类型慢性肝炎、各种原因引起的肝硬化、脂肪肝、急慢性胰腺炎、各种原因引起的腹膜炎等，对上述疾病诊断及时准确，治疗合理有效，达到国内先进水平。
设置床位6张，医护人员18人，其中主任医师1名，副主任医师1名，主治医师1名，住院医师2名，主管护理师1名，护理师4名，护士8名，分设呼吸组，心血管组，配备心电监护仪6台，除颤仪1台，有创呼吸机6台，急救车，气管插管，咽喉镜，简易呼吸器，快速血糖仪，纤维支气管镜，中心静脉置管，微量输液泵8台，心电图机1台，床旁连续血液滤过治疗仪1台，血气分析仪1台，肠内营养输液泵，不间断电力系统，能熟练实施心肺复苏技术，人工气道的建立与管理技术，有创及无创机械通气技术，血液动力学监测技术，床旁血液滤过技术，各种心律失常电复律技术，床旁支气管镜检查及镜下治疗技术。 主要服务对象：各临床、医技科室可能出现或已存在脏器功能不全、有生命危险，但经短期集中强化治疗可望恢复者。
医生姓名：热西提·艾孜木
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
医生姓名：夏晓莉
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
医生姓名：刘健
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：心内科
医生姓名：艾丽努尔·玉努斯
综合评分：4700
医生资格：主任医师
科室细分：心内科
血液科治疗良性血液病如：缺铁性贫血，巨幼细胞性贫血，溶血性贫血，过敏性紫癜，血小板减少性紫癜，白细胞减少及粒细胞减少等方面有独到的理念。轻症患者门诊治疗，通过用药及随诊，做好饮食及预防措施指导，使患者尽快取得痊愈。重症患者住院治疗，力求快速有效的使患者转危为安，尽早痊愈。
骨科成立于1954年，是当时自治区各医院中较早成立骨科专业科室之一。 成立后开展了脊柱结核病灶清除、半月板切除、四肢骨折钢板固定和股骨骨折髓腔内固定关节成形、肌腱移植等手术，并在外科医师的协助下开展胸椎结核病灶清除术，填补了当时新疆骨科此项手术的空白。该科医师能熟练地诊断和治疗四肢骨折及脊柱骨折，对老年性骨质疏松、足跟痛症、踇外翻，骨结核与骨关节病的治疗都有独到之处，特别是对腰椎间盘突出症摸索出了由保守治疗、镇痛治疗、经皮旋切治疗到手术治疗的一整套阶梯治疗方案，根据病人的不同病情，审慎论证、综合分析，制定出优异治疗方案，使患者早日康复。
医生姓名：阿布都瓦依提·依明
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：张浩
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：阿地里·穆罕麦
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：骨科
医生姓名：白合提亚尔·吐尔干
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：骨科
泌尿外科成立于七十年代，2000年该科又成立了乌鲁木齐市碎石中心。 先后开展用德国STROZ电切刀行经尿道前列腺电切术，腔镜手术率达95％；将内腔镜引进并广泛用于泌尿外科手术中，腺性膀胱炎及膀胱肿瘤电切术，腹腔镜下肾囊肿去顶减压术，腹腔镜下精索静脉高位结扎术，并在国内专家的指导下先后进行了肾上腺肿瘤根治术、肾癌及肾盂癌根治术；开展了窥视下尿道内切开术；
医生姓名：张宁
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：泌尿外科
医生姓名：古丽米热•肉孜
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：泌尿外科
医生姓名：张洁祥
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：泌尿外科
普外一科成立于五十年代，先后开展了具有疆内先进水平的各类手术：曾完成直视下肝叶切除、肝硬化门脉高压症断流及分流术(脾脏及脾、肾分流术)，胰头癌、壶腹癌及胰十二指肠损伤的胰、十二指肠切除术。对部分肝血管瘤和巨大肝血管瘤实施介入下选择性肝动脉插管栓塞术，腹部各种肿瘤及甲状腺癌、乳腺癌等根治性手术；在全疆较早开展经皮肝穿刺胆道逆行造影术及胆道内外引流术。
医生姓名：巴音克西
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：普外科
医生姓名：范重光
综合评分：5300
医生资格：主任医师
科室细分：普外科
医生姓名：李晨
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：普外科
医生姓名：马合木提·伊民
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：普外科
神经外科于2010年1月恢复为独立科室。 主要收治颅脑损伤、脑血管疾病、颅内肿瘤、颅骨畸形、颅骨肿瘤、癫痫、脊髓病变、各种原因引起的脑积水等患者，已开展各种颅内血肿清除术、脑动脉瘤夹闭术及栓塞术、脑垂体瘤切除术、颅内肿瘤切除术、脑积水脑室—腹腔分流术、骨髓栓系松解术、小脑肿瘤切除术、各种颅骨整形及修补术等各类神经外科手术及显微外科手术。
医生姓名：焦风
综合评分：5300
医生资格：主治医生
科室细分：神经外科
医生姓名：王军跃
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经外科
医生姓名：钟杰
综合评分：4700
医生资格：副主任医生
科室细分：神经外科
心胸外科设以心外科、胸外科及急诊外科为主的综合科室。 心脏外科：目前开展了如房缺、室缺、法乐氏四联症等先天性心脏病的矫治；风湿性心脏病的手术治疗；缺血性心肌病的手术治疗、冠状动脉旁路移植手术及大血管病的手术治疗。2007—2008年间，在上海市胸科医院专家的帮助支持下，该科成功实施心脏房间隔缺损修补术和心脏主动脉瓣置换术各一例，为3名先天性心脏病患儿分别成功实施了“上腔静脉——右肺动脉分流术”、“动脉导管结扎术”、“心脏瓣膜修补术”。
妇产科配备有腹腔镜、宫腔镜、电子阴道镜、妇科疾病射频治疗仪、LeeP刀、B超、微波治疗仪、胎心监护仪、羊膜镜等各种先进的检查治疗设备。 开展各类妇科手术：腹腔镜、介入、射频、中药治疗子宫肌瘤；腹腔镜、开腹、中药治疗卵巢囊肿、宫外孕、不孕症、子宫内膜异位症、顽固性盆腔炎、附件炎；对宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌可手术、化疗、介入治疗；宫腔镜诊治功血、子宫黏膜下肌瘤、子宫内膜息肉、环嵌顿、子宫内膜癌；宫颈刮片、电子阴道镜诊断宫颈炎、癌前病变、宫颈癌；能对子宫脱垂、阴道前后壁膨出、张力性尿失禁、先天性阴道畸形等开展阴式子宫全切、阴道前后壁修补、膀胱悬吊、阴道整形术。能开展各种计划生育手术，无痛人流。能对生理、病理妊娠进行各种监护，筛出高危妊娠，抢救子痫、前置胎盘、胎盘早剥、胎盘植入、产后大出血、妊娠合并贫血、合并心脏病、糖尿病、肝病等。介入抢救治疗产后出血、胎盘植入，保留患者子宫。
儿科在对儿科常见病及多发病方面具有系统的诊断和治疗方法，特别在支气管哮喘，过敏性紫癜、癫痫的诊断及治疗方面具有丰富的临床经验，取得了良好的社会效益；对急、危重病人的抢救成功率、疑难病症的诊断率均较高；在新生儿窒息缺血、缺氧性脑病、脑瘫等疾病治疗上有独到的方法及丰富的经验。
耳、鼻、咽喉科能对常见病、多发病及一些疑难病、少见病提供正确的诊断及治疗，能够开展常规手术，为适应本专业向着现代耳、鼻、咽喉科发展的趋势，适应微创外科手术及检查治疗的需要，开展常规的鼻及鼻窦内窥镜外科技术，在喉息肉的手术及术后病人康复过程中，充分发挥西医手术治疗的基础上结合中医中草药辨证施治的原则，有特色；对近年来临床所关注的鼾症也能进行诊断及鉴别诊断，并掌握手术适应症，同时根据病人的不同情况，进行多种方式的选择及治疗，且有肯定的疗效。
口腔科配备8把全自动牙科椅，牙科全景拍片机、洁牙机、电离子手术治疗仪、光固化机等口腔诊疗设备。 开展业务范围： 1、牙体牙髓病的治疗，包括龋齿充填、根管治疗、光固化贴面等。 2、牙周病及粘膜病的治疗，包括牙龈切除、牙翻瓣术、牙夹板固定治疗，电离子治疗口腔粘膜病，中西医结合治疗口腔粘膜病。 3、口腔颌面外科，包括牙齿拔除，口腔颌面部炎症的治疗，外伤引起的颌面部畸形，颌骨骨折的治疗。颌面部肿瘤的诊治，涎腺疾病及颞下颌关节病变的诊治，三叉神经痛和面神经麻痹的诊治，牙体的移植、再植、种植，对高血压心脏病拔牙患者开设心电监护。口腔颌面外科急救手术。 4、口腔修复（镶牙）包括活动义齿修复和固定义齿修复，如：烤瓷牙、隐形牙、铸造牙。 5、口腔正畸，包括固定矫治，活动矫治。
眼科有多台精密眼科设备及仪器。有莱卡—841手术显微镜、眼力健公司白星冷超声乳化治疗仪、瑞士Octopus—101视野仪、Topcon—2000TM眼底荧光造影仪和非接触眼压仪、眼电生理仪、蔡司532眼底激光治疗仪、ODM—1000A／P超声仪、眼A／B超仪、可拍照裂隙灯显微镜等数台国内外先进设备及间接检眼镜、全视网膜镜等系列眼后节检查设备，并配有独立的眼科专用手术室。
急诊科成立于1996年，分设急诊内科和急诊外科，配备有先进齐备的急救、监护设备。有PB—840型、SV—300型、车载便携式呼吸机、PV—102型呼吸机各1台，I—STA血气分析仪、EUB—305 B超机、全自动洗胃机、除颤仪、美国太空实验监护除颤仪、床边X机，大、小玛奎特心电图机各1台，惠普监护仪9台，监护型救护车1辆，24小时待命。
皮肤科于1981年建科，为综合三级甲等医院设备较全、技术力量较强，治疗、检查项目较多的一个临床专业科室。 主要治疗皮肤及附属器的常见病、多发病及各种性病，如过敏性皮肤病、病毒性、细菌性、真菌性、寄生虫及昆虫性皮肤病及物理性皮肤病，营养性、色素障碍性皮肤病、遗传性皮肤病，对慢性湿疹皮炎、银屑病及各种免疫性皮肤病等治疗也有独到之处。
康复科成立于2002年8月，与南京医科大学第一附属医院（江苏省人民医院）康复医学科合作，成为江苏省康复医学会新疆康复医学基地，是乌鲁木齐三级甲等医院中开展较早、治疗措施科学规范的康复医学科，配置有PT、OT设备，言语与吞咽功能恢复设备，减重步态、肢体气压、运动平板、全身运动训练系统，各种关节活动度训练仪器，蜡疗、功能性电刺激仪，偏瘫、痉挛治疗仪器，超声及微波治疗仪，颈、腰椎牵引治疗仪等一批先进的康复医疗设备，设置床位40张。
中医科设有病房和门诊、针灸室、推拿室、足疗室、血疗室、腊疗室、塌渍室、熏蒸室。对中医内科、中医妇科、中医儿科等常见及多发疾病治疗有特色；对面瘫、半身不遂、肩周炎、痹症等疾病的治疗有独到的疗效。科室在“三氧”治疗内科各种疾病有独到的一面，对高粘血症；高脂血症疗效显著。
技术水平和规模在全疆疼痛领域处于领跑地位。三十余年来在治疗腰颈椎病、带状疱疹、癌症晚期临终关怀、三叉神经疼、呃逆诊断治疗方面均在疆内属先进水平；同时在痛经、甲亢、神经疼痛、失眠、更年期综合症等疾病的治疗方面取得了独到进展并取得良好效果。
营养科设立了肠内、肠外配制组、临床诊疗组、饮食治疗组。 开展包括临床营养支持，肠内、肠外营养制剂的配制，营养科学方面的教学、科普、科研等工作。 临床营养治疗组是专门诊断、治疗营养代谢性疾病的专科。主要诊治的疾病有：代谢综合征、各种营养素缺乏症，糖尿病、肥胖症、水电解质平衡紊乱、痛风、骨质疏松症等。
保健科设置有体检中心，干部保健、老年病门诊，方便门诊，智力测试门诊，心理咨询门诊，肠道病门诊。科室配有心电图机、彩色B超、四肢多普勒监测仪、红外线电脑身高体重测量仪等大型医疗设备。 承担各种常见病、慢性病的诊治，传染病及死亡病例上报，艾滋病自愿咨询检验及艾滋病治疗管理、结核病治疗规范化管理、智力测定、心理咨询等工作。体检中心每年完成上级指令性体检如：高考体检、征兵体检、公务员体检、内地高中班体检等大型体检任务；另外，还负责各单位健康体检及门诊体检、入职体检等。如有单位人员集体体检，科室人员均提前上班准备，并有接待人员、导医护士为受检人员服务；专职体检人员做到检查认真仔细、诊断准确，体检结束后，由该科医师写出体检结论及防治意见、健康温馨提示，由专职人员输入电脑存档，并打印体检报告，在10个工作日内，把体检报告发放到体检者手中。同时，根据单位要求进行有关体检项目的健康讲座或电话咨询。该科在对中、老年慢性疾病的诊断、预防、保健工作方面积累了丰富的临床经验，并在门诊治疗中突出全科医师及保健科诊疗特点，对病人进行健康宣教，为各科收治病人，2003年被市残疾人联合会指定为全疆的智力残疾评定点。
麻醉科承担全院外科系各类手术麻醉、围手术期准备、急、危重症病人的抢救、复苏、术后镇痛。 科室配备有全功能进口麻醉机4台、多功能生命体征监护仪8台、心脏除颤仪2台。 可开展心脏病体外循环麻醉，全身麻醉（吸入，静脉，静脉、吸入复合）；椎管内麻醉（蛛网膜下腔，硬膜外，骶管，腰、硬联合）；部位麻醉（局部神经阻滞如颈丛神经阻滞、臂丛神经阻滞、上肢神经阻滞、下肢神经阻滞等）。可实施术中桡动脉、中心静脉压、呼气末二氧化碳监测，可行经鼻气管插管、双腔气管插管。配合完成了一些高难度手术的麻醉工作。开展了控制性降压麻醉、C型臂下手术麻醉、浅全麻加硬膜外麻醉等新工作。
整形科为在全疆首先开展吸脂减肥形体塑形手术、面部微创除皱手术、面部轮廓改型手术 （下颌角肥大矫正、颧骨过高矫正等）、颗粒脂肪移植手术的科室；对瘢痕疙瘩有特殊有效的治疗方法，颗粒脂肪冷冻移植手术为该科优先研究并应用于临床的新技术，为该科研究成果。面部轮廓改型手术新方法的开展更是该科实力的象征。
重症医学一科（外科ICU）成立于2009年10月，是一个技术力量雄厚、功能齐全、制度完善的综合性科室。 主要收治外科术后各类疑难危重病人，能够对各种急、危、重症病人如各种重大高危手术后（高危、老龄患者术后等）、严重创伤术后、心、肺、脑复苏等患者实施及时、有效、不间断的监护及救治，特别是在重症胰腺炎、重度多发伤、MODS、呼吸衰竭等方面疾病的诊治具有丰富经验。承担心脏直视手术患者术后监护治疗工作。常规开展心电、呼吸、血氧饱和度、呼末CO2、无创心排监测、无创、有创血压胳测、床旁血气检测等，常规开展经皮气管切开、机械通气。通过纤维支气管镜，连续床旁肾脏替代血液净化治疗技术，肠内营养支持等一列综合治疗手段，提高了抢救成功率，充分发挥了外科重症监护室在危重病人抢救、治疗中的作用。
